燕王朱棣经靖难之变后夺得皇位后，于永乐元年（1403年）改北平为北京，是为“行在”（天子行銮驻跸的所在，就称“行在”）且常驻于此，如今的北京也从此得名。清兵入关后即进驻北京，亦称北京为京师顺天府，属直隶省。
民国伊始，北京的地方体制仍依清制，称顺天府。直至民国三年（1914年），改顺天府为京兆地方，范围规格与顺天府大致相同，直辖于中央政府北洋政府。这一时期，北京新建了有轨电车系统，和一批现代的文化教育机构，如北京大学、北京师范大学、燕京大学、辅仁大学、协和医学院等。民国十七年（1928年）六月，北伐战争后，由于蒋介石不重视北方边防，把首都迁到南京，撤销原京兆地方，北京改名为北平特别市，后改为北平市，隶属于南京国民政府行政院。
1949年9月27日中国人民政治协商会议第一届全体会议通过《关于中华人民共和国国都、纪年、国歌、国旗的决议》，北平更名为北京。1949年10月1日，中华人民共和国中央人民政府在北京宣告成立。
