如果说李希霍芬对于北京抱有失望之情，那么对于南京，他则显示出一种傲慢和不屑。在“南京及其周边”的日记中，他毫不客气地写道:“半裸的乞丐，多大年龄的都有，看起来身上还有可怕的疾病，让人产生恶心……1868年的南京，经历了太平天国战乱后不久，几近成为废墟。在南京古城，处于外交上的礼仪，李希霍芬拜会了湖广总督李鸿章。当时的李鸿章处于人生仕途的上升期，在李希霍芬看来，李鸿章非常自信、活力无限，且做事麻利。然而他也是一个迷信之人，讲究风水。在当时中国的传统社会中，现代科学的理念尚未形成，上至李鸿章这样的高官，下至普通百姓，都受到怪力乱神迷信思想不同程度的影响。
晚清中国城市之中，李希霍芬对于武汉有别样的印象。武汉由汉口、武昌、汉阳三座大小不一的城镇组成，长江和汉水在此交汇，天然的地理交通优势，使得武汉在晚清时期就已是经济开放、商业繁荣、人口密集。位于长江之畔的汉口，和上海一样修建了无数西式建筑，码头上的商船川流不息。然而汉口地势偏低，每逢夏季，这里水多为患，汉口经常沦为“水城”。当初，西方国家在长江边修建房屋，设置领事馆和各种办事机构，当地人曾告诫他们应该考虑夏季的水患，建议他们在汉阳起屋建房，然而西方人自以为是，不予理会。后来果然要面对势不可挡的洪水。
李希霍芬在“长江下游的旅行”日记中写道:“江水漫过河滩，淹没了街道和花园并冲进来房子。外国人只好踩着一些木板活动，家具被放得越来越高，几乎放到了一层的天花板上。后来我发现几乎每所房子里都放着一艘小船，在发水的时候可以坐船串门。”他的这番描写，一来是描绘了汉口水灾的真实场景，二来对西方人的固执进行了调侃。
李希霍芬在中国考察游历的四年时间里，不仅记录各地的地形地貌之特征，更主要的是圈点那些具有矿产资源开采潜力的区域。在李希霍芬看来，尽管晚清中国是一个沉睡多年刚刚梦醒的国家，社会沉闷颓废，文化素质低下，对于地质地理学以及现代科学处于蒙昧状态，但是在这个疆域广大的国家里，物产富饶，具有无可限量的发展潜力。人们常说科学无国界，但是科学家却有为之效劳的国家，李希霍芬的中国之行，谁说没有西方殖民色彩呢?
