随着部队战略展开，刘伯承、邓小平等师首长经常到鲁西、冀南等地区检查、指导工作，司政机关需有人跟随他们活动。作为宣传部代理部长，刘华清是邓小平下部队主要陪同人员之一。这时，他们工作生活在一起，无话不谈，相交日深。刘华清晚年在回忆录中，生动地记下了他一次随邓小平下部队中的趣事：
“一次，我随邓政委到邢台地区检查工作，地方党送来了一布袋现洋。邓政委叫我清点一下。我很少摸过银圆，更不用说一下子这么大一堆，眼都看花了。我很认真地一块一块数起来，数得很慢。邓政委笑了，说：‘看来你真是穷人的孩子，没见过银圆。’他教我先用10元摞成一柱，其余的比着堆就行。我如法炮制，很快就数完了，正好400元。”
1938年12月7日，第一二九师机关和直属队移驻涉县赤岸村。翌日，刘华清接到通知，去北方局党校学习。
1938年春，第一期开学时，刘华清曾要求去学习，因当时机关干部变动大，师首长没有同意。接到第二期调学的通知，邓小平首先想到了他。
参加党校第二期学习的100多名学员，大都是八路军的旅、团级干部。彼此间，有在战场上并肩战斗的战友，也有闻名已久的新交，大家聚在一起学习都非常兴奋。一下子结识这么多声名赫赫的战友，刘华清自然也很高兴。1939年4月底，第二期学习结束，学员们均很快离校返回部队，但刘华清被留下来。由于其学习成绩优异、表现突出，北方局党校经与八路军总部、一二九师商定，将刘华清留下来任校党总支书记，主持举办第三期学习班，做集训组织领导工作。
党校第三期于1939年5月开学。这一期扩大了招生人数，有200多人。作为党校总支书记，刘华清要担负从行政管理到各科教学的全面领导工作。根据实际情况，刘华清首先抓了党组织建设，高度重视发挥各级党组织的作用。同时，总结前两期的经验，健全完善了行政管理、课程教学、军事训练等各项制度。考虑到学员文化水平差距较大，实行打破条块界限，按学员文化程度合理编组，使学员之间可以互相学习、互相帮助。由于措施得力、办法灵活，第三期集训班搞得很有特色，军地干部团结，上下关系融洽，学员成绩也普遍较好。北方局的同志对此次集训非常满意，要求刘华清“认真总结一下”，并向八路军总部、第一二九师再次提出，希望刘华清能留下来，继续在党校工作一段。北方局征求刘华清的意见，他婉言谢绝。第一二九师态度也非常明确：刘华清要赶快回部队，另有安排。
9月初，学员毕业前，刘华清突击写出了《北方局党校工作的几点经验教训》一文。之后，他便回到第一二九师机关。当月，他即被任命为师供给部政治部主任。
刘华清不愿意留在北方局党校，原是希望能到前线部队带兵打仗，没想到却要自己做后勤工作，他实在心有不甘。然而，到职工作一段后，他才理解了师首长的良苦用心。
对第一二九师来说，后勤供给工作尤其重要。红军改编以后，国民党政府虽然给八路军拨发了部分军饷和军需物资，但标准极低，数量很少。随着根据地开辟、部队发展，大量军需物资补给需自行筹措。战争环境下，筹措物资不易，有了物资存放同样不易。弹药、服装、医药和工兵器材等，部队一时发不下去、运不出的就藏在群众家或深山密林中。因此，第一二九师供给部工作头绪多、辖属人员多、摊子大，兵站、仓库、医院、工厂等分布方圆数百里，工作难度非常大。一段时间以来，师首长明显感受到供给工作很不得力。
