北京大运河博物馆总建筑面积约9.97万平方米，由共享大厅、展陈大楼（主楼）和休闲水街组成。

“博物馆设计理念源于古运河图景中的船、帆、水3个元素。”北京城市副中心投资建设集团有限公司重大项目总监陈宏达介绍，主楼屋顶形似巨帆，高高扬起。共享大厅屋顶状如船只，坚实厚重。两座建筑之间有一条长约270米、宽约20米的休闲水街，水街两侧的街巷路口、篷架、门楼等造型与水系相结合，形成一处类似运河驳岸码头的场景。当观众穿行时，可通过水街两侧的玻璃幕墙看到博物馆内部，不入馆也能感受博物馆的魅力。水街在夜间也对公众开放，形成“永不落幕的展览”。

除了别具一格的外观，北京大运河博物馆的抗震设计也可圈可点。博物馆主楼周边设置了长达620米的隔震沟，地下一层下方设置了1.8万平方米的隔震层，是国内已建成的隔震博物馆中隔震区域投影面积最大的。“隔震层内共有242个隔震支座，将整座博物馆托举起来，阻断了地震波的传播路径，确保藏品、人员、场馆的安全。”首都博物馆展览部策展人赵雅卓说，“隔震层、隔震沟对文物库房的防水、防潮也有很大帮助。”

依托博物馆抗震设施打造的“防震科普展”让人耳目一新。走进展厅，透过地面和墙面预留的几扇玻璃“窗口”望去，博物馆仿佛被“掀”开一角，楼体下方的隔震支座和墙体之间的隔震沟一览无余。

一块球形屏幕，直观展示地球内部圈层和地震带的知识；戴上VR眼镜，感受地震来袭时建筑的摇晃位移；用积木搭一座房子，体验不同构造建筑的抗震性能……展览融知识与趣味于一体，吸引了许多观众尤其是青少年参观体验。

讲述河与城的故事

人们常说“大运河漂来的北京城”，形象地表现了北京城与大运河密不可分的关系。千百年来，大运河对北京的经济发展和文化交融起到了重要促进作用，推动北京从北疆重镇发展为国家都城。