考古人员在过去一年的发掘中，在内城范围内发现祆教寺院且面积有约500平方米的规模，并在寺院处发现了大量用火遗迹，烧骨、房址和祭祀坑等，证实了祆教在当时的地位。

而结合祆教用寂灭塔天葬的方式，考古人员推断，内城最高处的梯形塔基形建筑，在原研究认为的角楼、烽火台的基础上，又增加了寂灭塔的可能性。

据史料记载，唐王城曾兴小乘佛教，僧人众多，佛事不绝，很可能是佛教从西方传入我国之后，在塔里木盆地的一个传播中心。而目前的出土文物也印证了这些记载。

还有更多谜有待解开

经过考古发掘，为进一步了解唐王城城址形制提供了重要线索，为探讨城址性质、时代、宗教信仰、社会材料提供了重要材料，也为下一步发掘打下了基础。但用“冰山一角”来形容目前唐王城遗址的考古发现，丝毫不为过。

结合近两年来对唐王城遗址调查、勘探、发掘情况，国家文物局考古研究中心认为，该遗址面积巨大，保守估计在70万平方米左右，且构成极为复杂，分为四重城，分别是小城（古城）、内城、外城、大外城，各城圈范围内又有不同的功能分区，需要开展长期的考古发掘。

在当地维吾尔语中，唐王城遗址被称为“托库孜萨来”，汉语意为“九座驿站”或“九座烽燧”。而常说的托库孜萨来遗址群主要包括托库孜萨来古城址、托库孜萨来佛寺遗址、图木舒克佛寺遗址、克克勒玛佛寺遗址、坎斯坎套佛寺遗址、托格拉塔格佛寺遗址等6处主要遗址，这一遗址群结构可以概括为“五寺拱卫一城”。

在方圆十公里范围内密集发现多处古代遗迹，充分说明该区域在古代的繁荣昌盛。从1928年到新中国成立初期，我国考古学家黄文弼、李遇春都曾到唐王城遗址进行调查、试掘，挖掘出了一批文物。2021年开始，经过国家文物局批准，考古研究中心联合新疆、兵团以及地方考古单位组成项目组，正式开展考古发掘。

现在，国家文物局考古研究中心启动唐王城遗址考古（第二期），推动唐王城遗址考古研究和唐王城历史文化研究利用迈入新的历史阶段，也揭开了南疆地区考古和兵团文物考古事业的新篇章。