《奇迹男孩》讲述的是一个因为特雷彻·柯林斯（Treacher Collins）综合征而造成先天面部畸形的小男孩，如何在家人、老师及朋友的关爱下，一点点获得自信、成功踏入校园的故事。特雷彻·柯林斯综合征是一种先天性脸颊骨及下颌骨发育不全的疾病，该种疾病还会导致呼吸道狭窄及听力障碍，但并不会传染及智力低下。
《奇迹男孩》海报
影片的主人公奥吉是一个在科学方面有着极高的天赋，观察力敏锐，头脑反应敏捷，喜欢梦想自己是一个宇航员，被人们欢呼着、簇拥着的孩子。可就这样一个孩子，却因为这种罕见的疾病而一直被周围人排斥且极度自卑着。奥吉的母亲为了照顾奥吉的病，暂时放弃了自己的研究与事业，一门心思在家照看奥吉并担负着教育的职责，一直到奥吉成长到了应该上五年级的年龄。奥吉的母亲因为担心再继续家庭教育的话，长大后的奥吉可能会融入不了社会，因而为奥吉联系了一所小学，希望他能在正常的教育环境下尽快融入集体当中去。在他学会照顾自己、与人相处的同时，也给这个多年来一直围绕着他忙碌的家庭一个喘息的机会。
从事多年教育的图什曼校长考虑到奥吉可能会不适应，在暑假中就贴心地为奥吉叫来了三个孩子：朱利安、夏洛特和杰克。这三个孩子恰恰代表了人们对于奥吉的三个态度及采取的应对行为：厌恶和欺凌、怜悯和旁观、友善和援助。学校是成人社会的反射，这一点毋庸置疑。在家庭中大人是如何行事，孩子们就会真实地在学校中反映出来。
