石涛工诗文，善书画，山水广采历代画家之长，将传统笔墨技法加以变化，又注重师法造化，主张“搜尽奇峰打草稿”，所作笔法纵横排奡，灵活自由，或细笔勾勒，很少皴擦，或粗线勾斫，皴点并用，尤长于点苔，密密麻麻，丰富多彩，有时又多方拙之笔，方圆结合，秀拙相生。石涛善用墨法，枯湿浓淡兼施并用，尤其喜欢用湿笔，通过水墨的渗化和笔墨的融合，表现出山川的氤氲气象和深厚之态，极尽变化。其构图新奇，无论是黄山云烟、江南水墨，还是悬崖峭壁、枯树寒鸦，或全景式场面宏阔，或局部特写，景物突出，变幻无穷，尤其善用“截取法”以特写之景传达深邃之境，充满了动感与张力。石涛的花鸟、兰竹，亦不拘成法，平中见奇，笔力深沉而灵巧，设色淡雅而不伤笔墨，又善于题跋，诗文中含画理，自抒胸臆，情深意远。

晚年的石涛在扬州广收门徒，传播自己的画艺，并通过广泛的人脉拓展市场，持续地影响着扬州、徽州的书画收藏活动。正如阎安所言，石涛“以书画娱人的同时也为徽商培养了艺术家，促使徽商由艺术的欣赏者、收藏者，成为艺术的创造者”，石涛绘画在徽商的引导之下成了扬州绘画时髦的新风尚。

需要强调的是，石涛变查士标式的新安绘画之清冷孤寂为雄健沉郁而自成一家，正好能够符合康熙中后期扬州盐商的欣赏口味，造成了清初扬州文人画坛上的一次转变。康熙三十九年(1700)，石涛经过多年的潜心思考，完成了完整的绘画理论著述《苦瓜和尚画语录》，不遗余力地倡导画家摆脱泥古模仿、突出自我，开一代新风，对后来扬州八怪的兴起产生了直接的影响。