六十六岁时，公出洛阳返回临海，过扬州与徐敬业等相聚，酝酿反对武则天的起义。秋天起兵扬州，骆宾王任“艺文令”，写下著名的《讨武氏檄》。据说武则天读这篇檄文时，读到“蛾眉不肯让人，狐媚偏能惑主”，“微笑而已”，读到“一抔之土未干，六尺之孤安在”时，则天不悦，认为“宰相何得失如此人”！可见其文采之出众。扬州兵起后，武后问策于中书令裴炎，裴炎建议归政睿宗，被诬陷与徐敬业串通而斩首。在其被斩之前，徐敬业已兵败，但笔记小说中将此事演绎为另一版本：为了拉拢裴炎一起反对武则天、在朝廷中里应外合，徐敬业让骆宾王想计策。骆宾王“静思食顷”，编了首儿歌“一片火，两片火，绯衣小二坐殿堂”，教裴炎的田庄上的孩童传唱。待洛阳小儿都会唱了，传到裴炎耳中，骆宾王又去拜访裴炎，以天命之由说服了裴炎。徐敬业起义，裴炎写信给他，信中只有“青鵞”二字。有人告密，朝廷大臣都猜不透，唯独武则天破译，青指十二月，鵞指裴将为内应。故杀裴炎，扬州判兵也跟着败了。
这些故事，包括骆宾王最后结局之传言，皆从百姓对徐敬业等人的敬爱而起。骆宾王的结局有三种说法，兵败逃跑时被部下杀害，逃亡后客死异乡，及出家灵隐寺。《本事诗》中有骆宾王与宋之问灵隐寺连句的详细记录。而明朝笔记中称，正德年间南通曾掘出骆宾王的墓，打开棺材，“见一人，衣冠如新”。清朝人因防水患，将墓迁至南通狼山东麓，有人特意为此写诗。无论何种情形，骆宾王自从兵败后便再未现身。中宗反正后，出于对他文名之敬重，亦为了表彰他对李唐王朝的衷心，命人搜集整理他的诗文，共得十卷，流传中散失不少，现存诗文赋合计一百余篇。
纵观骆宾王一生，可谓少年出众，青年不得志蹉跎苦修，中年失意后归隐，十二年后重出江湖奔波征战，遭重创，最终决一死战，战败后飘摇而去，无迹可寻。如果金庸肯将骆宾王作其小说原型，那必将又是一部引人入胜的“恩仇录”。
