刘秉忠跟随忽必烈左右,因已出家,因而穿的仍是和尚服,他法名子聪,又为忽必烈掌管文案,所以人们都叫他“聪书记”。直到忽必烈至元元年(1264),一位任翰林学士承旨叫王鹗的上奏说:刘秉忠在皇上还当藩王时就跟随侍候皇上,间很久了,其间参与运筹帷幄,策划了建设国家的大计,忠心耿耿,劳苦功高,应予褒扬。皇上登基,万象更新,刘秉忠却还穿着出家人的衣服,也没有封号,是不适当的,应请他穿符合礼仪的衣服,封他应有的职位。忽必烈准奏,即日便拜刘秉忠光禄大夫,位太保,参领中书省事。光禄大夫位一品,太保不仅是一品官,而且位列三公。刘秉忠位极人臣,可见元世祖忽必烈对刘秉忠的重视与信任。忽必烈封了刘秉忠官后,又下诏让他娶翰林学士窦默之女为妻,并赐与府第。而刘秉忠也不辜负忽必烈的恩宠和信任,以天下为己任,事无巨细,凡事关国家者,总是知无不言,言无不尽,忽必烈也就对他更为信任。他举贤荐能,全出自公心,经他识别提拔的人,差不多都成了名臣。
刘秉忠除帮助忽必烈设计了建国的蓝图外,他还是元朝两座都城即上都和大都的设计者,在中国乃至世界的城市建设史上,留下了世人惊叹的极其辉煌的成果。蒙哥汗六年(1256),忽必烈还在潜邸,但已有雄霸中原的计划,为了进军中原,他要求刘秉忠在桓州东、滦水北设计修建一座城,刘秉忠用了3年的时间完成了这一工作。城修好后,取名开平,后来升为上都,忽必烈就是在此登上皇帝宝座的,其遗址在今内蒙正蓝旗东20公里处。至元三年(1266),刘秉忠又奉命在原燕京城东北设计建造新的都城,取名大都,即今天的北京城前身。大都从至元四年(1267)开始修建,到至元二十二年(1285)完成,共用了18年时间。刘秉忠虽然没有看到修好的新都城是什么模样,但大都的蓝图是他为主设计的,因此,仍不影响他作为世界史上最伟大的城市设计师之一名垂青史。