日本殖民统治台湾时期，在主客观条件限制之下，台湾进步知识分子或是投入反殖运动的先贤先烈，他们很多思想资源都来自于日本，这一点与19世纪末、20世纪初的中国大陆有类似的经验；台湾许多热血青年，为了参加祖国对日抗战，也是取道日本再进入大陆本土。及至台湾光复之后，许多参加地下党斗争的台湾青年，也是将日本视为维持进步思想的重要管道之一，进而在社会主义的理想之下，追求两岸中国人的民族统一与解放。当代台湾社会变革运动几位前辈，例如陈明忠先生，以及已故的林书扬、陈映真先生，同样与日本民间进步团体有着相当密切的合作与连系。
日本殖民经验在战后台湾社会发展历程中留下了深刻的印记，与日本关系之中的进步思想与价值何以不断在隐没，而自我殖民与右翼反动势力的连结何以不断在抬头，历史课纲与教科书的变动或许映照出了部分的足迹，但是幽隐在中国近代史之下台湾社会的心灵伤痛，应该是难以回避的关键。陈映真晚年留下的小说作品《忠孝公园》试图处理殖民经验对于台湾人民的深切影响，他没有给出答案，
台湾“失根”的历史与认同，是中国近代历史命运之中最为悲痛的伤痕。只有把台湾的现实问题，摆回中国历史的视野之中，将包括殖民经验在内的台湾历史特殊性，视为中国历史的有机组成部分，才有解决历史认识与认同困惑的可能性。
