清初沿袭明制，设五城兵马司，隶属都察院，负责巡查京城内东、西、南、北、中五城的治安管理、审理诉讼、缉捕盗贼等事，街巷不安当然也归其负责。兵马司官员巡查后，将打磨厂噪音烟尘等问题上报到都察院。都察院遂令兵马司告知所有打磨作坊“或歇业或迁出，无以扰民”，随后，石器打磨作坊相继关闭，或迁出城里，但仍有一些铜铁作坊经过“疏通”关系，继续经营，多年后才逐渐关张。
这些打磨作坊关闭或迁出具体是什么时候？有的说是顺治年间，有的说是康熙年间，还有的说是清末。清人笔记《南城琐记》称：“打磨厂石作或康乾时遂已消失，皆因为民不安，令其歇业，石工返于京西者居多，唯打磨厂之名尚存。”而清末《燕京杂记》称：“打磨厂临近崇文门，尚无石作之业，石器打磨为民不安宁，早已迁出，至今该处刀具店、五金行等尚存。”
康熙皇帝颁旨
关闭污染严重的黑窑厂
黑窑厂位于陶然亭公园北门北边，因早年间开设窑厂得名。由于这里的窑所烧制的砖瓦颜色皆为灰黑，有别于其他彩釉、琉璃，故称“黑窑”。据《北京古代建筑史话》载：早在金元时期这里就有窑厂，明永乐皇帝在北京建造宫殿，修筑城墙时，工部衙门设立了五个制造砖瓦的窑厂，黑窑厂是其中之一，以烧制灰瓦、大小开条砖、斧刃砖为主。《钦定日下旧闻考》卷六十一《城市(外城北城)》载：“黑窑厂为明代制造砖瓦之地。曰黑窑，别于琉璃、亮瓦二窑也。本朝之制，琉璃、亮瓦窑皆仍明旧，至各工程砖瓦，于康熙三十三年(1694年)奉旨，均交窑户备办。”《明诸司职掌》则记载了黑窑厂每窑的概况：“黑窑，每中窑一座，砖瓦之属二千二百，计匹八十八工，五尺围芦柴八十八束。”
