关于其头风病的加重原因是因为其亲自处理国家大政，导致日渐严重，随即令华佗为之专用侍医。特别是在建安元年，汉献帝迁都许昌，曹操“挟天子以令诸侯”，五年之后官渡之战败走袁绍，四年之后再度击败袁尚，其定都邺城，再到击杀袁谭等，整个袁氏集团的倒台都是全面亲力亲为，这也令曹操处理朝政的时间变得越来越繁忙，其头风病频发，而专职侍医的华佗却请假回家了。
关于华佗请假的缘由，《后汉书》记载其借口回家取药方，而在《三国志》的记载当中表示其收到家信，最终曹操准假，而回家之后以妻子病未愈为由一直续假。刚开始，曹操还层多次写信，同时委派地方官进行催促，但是华佗依旧不动身，生性多疑的曹操在知道华佗一直不动身之时，勃然大怒，并且派出专人前去检查，随后发现华佗其妻属于装病，于是逮捕华佗，并投其入狱进行审讯，随后华佗也承认其犯有“欺骗罪”。
看到曹操勃然大怒之后，曹操的首席谋士荀彧为此感到担忧，其向曹操进言，华佗其医术着实高明，存在事关诸多人之性命，还是赦免为佳。而曹操早就对其阳奉阴违不满，完全不听荀彧意见，并表示不用担心，不相信缺其不可。于是，最后神医枉死。
而曹操在杀死华佗之后，其曾公开表态称，乃华佗有意刁难，原本可以治好其头风病，但是却不作为，并且以此抬高身价，而且即便是不杀华佗，其也不会为其彻底治愈头风病。后史书证明，曹操最终死于脑疾，也就是头风病引起，而坊间同样有传言称，当时华佗曾提出开颅治疗，但是生性多疑的曹操怀疑华佗的动机，最终气愤的将华佗轰出门去，于建安二十五年正月，病死洛阳，终年66岁。
