对比之后可知，类似文字、描写的差异有很多。大多数情况下，都是脂本比程高本好。下面再说一个关系到《红楼梦》情节差异的问题。
各位朋友，如果我问林黛玉的前身是谁，大家都会毫不犹豫地回答：绛珠仙草。回答正确。但如果我再问，贾宝玉的前身是谁？许多朋友会回答：当然是那个天天用甘露灌溉滋润绛珠仙草的神瑛侍者了。回答当然正确。不过，这时一定会有读者要质疑了，并认为贾宝玉的前身应该是那个被遗弃在大荒山无稽崖青埂峰下的那块顽石，或者说顽石、神瑛侍者都是贾宝玉的前身。问题来了，贾宝玉的前身到底是神瑛侍者，还是顽石，或者说是神瑛侍者和顽石。可是，贾宝玉怎么会有两个前身呢？顽石与神瑛侍者又是什么关系呢？我要告诉诸位，不谈《红楼梦》版本问题，说不清楚顽石、神瑛侍者和贾宝玉之间的关系。而厘清他们之间的关系，正是新校本的一大特色，或者说一大贡献。
关于顽石、神瑛侍者和贾宝玉的关系，早期脂砚斋评本与程高本的描写很不同。但在新校注本依据的底本庚辰本中，也存在一些问题，有明显的矛盾，也没有交代清楚三者的关系。庚辰本中是这样写的：
列位看官：你道此书从何而来？说起根由虽近荒唐，细按则深有趣味。待在下将此来历注明，方使阅者了然不惑。原来女娲炼石补天之时，于大荒山无稽崖炼成高经十二丈、方经二十四丈顽石三万六千五百零一块，娲皇氏只用了三万六千五百块，只单单剩了一块没用，便弃在此山青埂峰下。谁知此石自经锻炼之后，灵性已通，因见众石俱得补天，独自己无才不堪入选，遂自怨自叹，日夜悲号惭愧。
后来，有一僧一道路过青埂峰下，看见一块鲜明莹洁的美玉，且又缩成扇坠大小的可佩可拿，那僧人说形体是一个宝物了，还要再镌上数字，然后带温柔富贵乡去安身乐业。说着便袖了这块石头，与道人飘然而去。又不知过了几世几劫，一僧一道又出现了，道人问僧人：“你携了这蠢物，意欲何往？”僧人笑道：“如今现有一段风流公案正该了结，这一干风流冤家尚未投胎入世。趁此机会，就将此蠢物夹带于中，使他去经历经历。”僧人口中说的“蠢物”显然指的是顽石。接着道人问这些风流冤孽什么事？僧人说，西方灵河岸上三生石畔，有绛珠仙草一株，时有赤霞宫神瑛侍者，日以甘露灌溉，在他的精心灌溉下，绛珠仙草变成了一个美女。一日，这位神瑛侍者凡心偶炽，要下凡去，绛珠仙草也要跟着去，还说要把一生的眼泪还给他。正因为有这样的机会，僧人说要去警幻仙子宫中，“将蠢物交割清楚”，也就是给顽石挂了号，以便神瑛侍者、绛珠仙草等投胎下凡，好把“蠢物”即顽石夹带下去。从庚辰本的描写看，顽石与神瑛侍者不是一回事，顽石是顽石，神瑛侍者是神瑛侍者，顽石到警幻仙姑那里挂号，是一僧一道带去的。顽石是随着神瑛侍者一干冤家投胎下凡的，他是被“夹带”下去的。但问题是，大荒山无稽崖青埂峰下的大顽石，是怎么变成了一块美玉的呢？他为什么要下凡呢？僧道二仙为什么要带顽石去警幻仙子的宫中去销号呢？对这些疑问，庚辰本中并没有交代清楚。
