伦敦大火灾始于9月2日凌晨，结束于9月5日，防火带措施最终奏效，大火在燃料消耗完毕后逐渐熄灭。
替罪羊
火灾余烟消散，9月底，英国议会组建火灾调查委员会，开始调查火灾起因。
1666年的英国适逢多事之秋。其一，数十年的英国政治和宗教动乱结束没多久，国内各派之间的利益矛盾和思想对抗尚未平息。其二，英国正与法国和荷兰交战，英国民众排外情绪高涨。因此，火灾第二天，有人故意纵火的谣言便流传开来。谁有作案动机呢？在大众眼里，因失势而愤愤不平的共和主义者，效忠于克伦威尔、图谋叛乱的军队，遭受迫害和排挤的天主教徒以及不信国教的新教徒，法国间谍或荷兰奸细，他们都是嫌疑犯。
很快，一个名叫罗伯特·休伯特的法国钟表匠被抓获，供述了犯罪经过，即他如何伙同23个同谋在面包店放火。可是，随着调查进展，一些事实浮出水面，与他的供词不一致。例如，他所乘坐的轮船船长证实，火灾发生两天后船才靠港，就是说，休伯特不可能在案发时出现在现场。再如，休伯特不知道法里诺的面包房没有窗户。还有，他一腿残疾，明显不具备作案能力。更蹊跷的是，证据明明有利于休伯特脱罪，他却在审判过程中不断修改口供，把自己往死路上推。对此，史学家克拉伦登伯爵在《英国叛乱和内战史》中评论道：无论法官还是出席审判的任何人，谁都不相信罗伯特·休伯特有罪，但他是个精神错乱的可怜人，意图自杀，一心求死。
判罪证据缺乏、证词漏洞百出，然而，英国人需要一个替罪羊来平息民愤和骚动，进而瓦解潜在的政治动荡。这个心智异常的法国人无疑是个完美的牺牲品。于是，罗伯特·休伯特被法庭定罪，于10月下旬被处以绞刑。
